Super Mario Bros. Wonder si è dimostrato facilmente emulabile sull’emulatore RyuJinx, senza problemi significativi. Sebbene l’emulatore Yuzu non permetteva di eseguirlo correttamente, ora il team è riuscito a superare gli ostacoli, e il gioco gira ancora meglio su Yuzu.
Da un po’ di tempo a questa parte, il team Yuzu ha adottato una politica di non fornire supporto per i giochi prima del loro rilascio pubblico.
Questo è stato uno dei motivi che hanno spinto alcuni modder nella realizzazione di una prima patch, mentre con gli aggiornamenti più recenti di Yuzu questa non è più necessaria.
Super Mario Bros. Wonder da Yuzu può essere eseguito anche su Steam Deck e dispositivi Android, ne sono un chiaro esempio i numerosi video presenti su YouTube che avrebbero mostrato il gioco in esecuzione su dispositivi dotati di processore ARM Snapdragon.